Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms