Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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