Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms