Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMDP50402 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMDP50402 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EMDP50402 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMDP50402 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms