Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms