Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TSFMP43897 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSFMP43897 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSFMP43897 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms