Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCAMP43121 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCAMP43121 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MCAMP43121 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCAMP43121 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCAMP43121 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms