Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPOP42166 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPOP42166 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPOP42166 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPOP42166 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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