Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGCXP38435 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGCXP38435 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms