Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.3 ms