Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA4P35212 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA4P35212 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA4P35212 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA4P35212 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms