Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms