Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms