Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRB3P28472 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms