Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms