Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO2P25791 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms