Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN8P19075 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms