Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPGDP15428 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPGDP15428 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPGDP15428 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms