Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms