Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms