Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEFHP12036 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEFHP12036 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms