Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms