Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms