Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms