Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBP07199 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CENPBP07199 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBP07199 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBP07199 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms