Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSD2O96028 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSD2O96028 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSD2O96028 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSD2O96028 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSD2O96028 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSD2O96028 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSD2O96028 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms