Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms