Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms