Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP17L11C9JVI0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L11C9JVI0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms