Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNRNPCL3B7ZW38 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms