Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms