Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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