Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOLGA6L9A6NEM1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms