Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms