Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms