Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms