Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms