Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms