Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRPC4Q9UBN4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms