Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms