Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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