Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNIH4Q9P003 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms