Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms