Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms