Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms