Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms