Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms