Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms