Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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