Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms